ژنوم 4

Genomes 4 has been completely revised and updated. It is a thoroughly modern textbook about genomes and how they are investigated. As with Genomes 3, techniques come first, then genome anatomies, followed by genome function, and finally genome evolution.  The genomes of all types of organism are covered: viruses, bacteria, fungi, plants, and animals including humans and other hominids.

Genome sequencing and assembly methods have been thoroughly revised including a survey of four genome projects: human, Neanderthal, giant panda, and barley. Coverage of genome annotation emphasizes genome-wide RNA mapping, with CRISPR-Cas 9 and GWAS methods of determining gene function covered. The knowledge gained from these techniques forms the basis of the three chapters that describe the three main types of genomes: eukaryotic, prokaryotic (including eukaryotic organelles), and viral (including mobile genetic elements). Coverage of genome expression and replication is truly genomic, concentrating on the genome-wide implications of DNA packaging, epigenome modifications, DNA-binding proteins, non-coding RNAs, regulatory genome sequences, and protein-protein interactions. Also included are applications of transcriptome analysis, metabolomics, and systems biology. The final chapter is on genome evolution, focusing on the evolution of the epigenome, using genomics to study human evolution, and using population genomics to advance plant breeding. Established methods of molecular biology are included if they are still relevant today and there is always an explanation as to why the method is still important. 

Each chapter has a set of short-answer questions, in-depth problems, and annotated further reading. There is also an extensive glossary. Genomes 4 is the ideal text for upper level courses focused on genomes and genomics.

ژنوم 4 به طور کامل بازبینی و به روز شده است. این یک کتاب درسی کاملاً مدرن در مورد ژنوم و چگونگی بررسی آنها است. همانند ژنوم 3، تکنیک ها ابتدا می آیند، سپس آناتومی ژنوم، به دنبال آن عملکرد ژنوم، و در نهایت تکامل ژنوم. ژنوم همه انواع ارگانیسم ها پوشیده شده است: ویروس ها، باکتری ها، قارچ ها، گیاهان و حیوانات از جمله انسان و سایر انسان سانان. روش های توالی یابی و مونتاژ ژنوم به طور کامل مورد بازبینی قرار گرفته اند که شامل بررسی چهار پروژه ژنومی انسان، نئاندرتال، پاندای غول پیکر و جو می شود. پوشش حاشیه نویسی ژنوم بر نگاشت RNA گسترده ژنوم، با پوشش روش های CRISPR-Cas 9 و GWAS برای تعیین عملکرد ژن تاکید دارد. دانش به دست آمده از این تکنیک ها اساس سه فصل را تشکیل می دهد که سه نوع اصلی ژنوم را شرح می دهد: یوکاریوتی، پروکاریوتی (شامل اندامک های یوکاریوتی)، و ویروسی (از جمله عناصر ژنتیکی متحرک). پوشش بیان و تکثیر ژنوم واقعاً ژنومی است و بر پیامدهای ژنوم بسته بندی DNA، تغییرات اپی ژنوم، پروتئین های متصل شونده به DNA، RNA های غیر کدکننده، توالی های ژنومی تنظیمی و برهمکنش های پروتئین-پروتئین متمرکز است. همچنین شامل برنامه های کاربردی تجزیه و تحلیل رونوشت، متابولومیک، و زیست شناسی سیستم ها می شود. فصل آخر در مورد تکامل ژنوم است، با تمرکز بر تکامل اپی ژنوم، استفاده از ژنومیک برای مطالعه تکامل انسان، و استفاده از ژنومیک جمعیت برای پیشبرد اصلاح نباتات. روش‌های تثبیت‌شده زیست‌شناسی مولکولی در صورتی گنجانده می‌شوند که امروزه هنوز مرتبط هستند و همیشه توضیحی وجود دارد که چرا این روش هنوز مهم است. هر فصل دارای مجموعه‌ای از سؤالات کوتاه، مسائل عمیق و توضیحات بیشتر است. همچنین یک واژه نامه گسترده وجود دارد. Genomes 4 متن ایده آلی برای دوره های سطح بالای متمرکز بر ژنوم و ژنومیک است.